Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm3542K7N6U2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3542K7N6U2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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