Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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