Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms