Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms