Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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