Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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