Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21863J3KMP8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms