Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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