Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan2G3X952 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms