Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms