Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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