Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rnf212F6TQD1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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