Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29094F6Q785 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms