Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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