Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms