Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo5cE9Q1F5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms