Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms