Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx6-2D3Z4R4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx6-2D3Z4R4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx6-2D3Z4R4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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