Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rfx8D3YU81 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rfx8D3YU81 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rfx8D3YU81 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rfx8D3YU81 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rfx8D3YU81 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rfx8D3YU81 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rfx8D3YU81 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rfx8D3YU81 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rfx8D3YU81 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rfx8D3YU81 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rfx8D3YU81 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rfx8D3YU81 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms