Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms