Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms