Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf518bB2RRE4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms