Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf1bp1B2KF50 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms