Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NhsB1AV60 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NhsB1AV60 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms