Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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H2-M5A7VMS3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M5A7VMS3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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