Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms