Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn6A2AJB9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lcn6A2AJB9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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