Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms