Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top3bQ9Z321 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top3bQ9Z321 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top3bQ9Z321 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms