Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer1Q9Z2Y3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer1Q9Z2Y3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer1Q9Z2Y3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms