Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd4Q9Z2D7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd4Q9Z2D7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms