Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccne2Q9Z238 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccne2Q9Z238 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccne2Q9Z238 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms