Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp4Q9Z1N6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms