Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N2

Orc1, Origin recognition complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc1Q9Z1N2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Orc1Q9Z1N2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Orc1Q9Z1N2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Orc1Q9Z1N2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms