Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna2d3Q9Z1L5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms