Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hmg20bQ9Z104 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmg20bQ9Z104 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms