Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skp2Q9Z0Z3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms