Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcn5Q9WVD4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn5Q9WVD4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms