Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stxbp4Q9WV89 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stxbp4Q9WV89 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stxbp4Q9WV89 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms