Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni1Q9WUZ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni1Q9WUZ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms