Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp18Q9WTV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms