Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ggps1Q9WTN0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggps1Q9WTN0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggps1Q9WTN0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggps1Q9WTN0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggps1Q9WTN0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggps1Q9WTN0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ggps1Q9WTN0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggps1Q9WTN0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggps1Q9WTN0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggps1Q9WTN0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggps1Q9WTN0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggps1Q9WTN0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggps1Q9WTN0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggps1Q9WTN0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms