Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfe2l3Q9WTM4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfe2l3Q9WTM4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2l3Q9WTM4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms