Protein–RNA interactions for Protein: Q9R2B6

St6galnac4, Alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1,3-N-acetyl-galactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac4Q9R2B6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
St6galnac4Q9R2B6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
St6galnac4Q9R2B6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms