Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NbnQ9R207 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NbnQ9R207 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NbnQ9R207 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms