Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms