Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma4Q9R1P0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma4Q9R1P0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms