Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trex2Q9R1A9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trex2Q9R1A9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms