Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfwd2Q9R1A8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms