Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek3Q9R0A5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms